Comandancia General de la Armada
SUBM-CN Leonardo Trasmonte Carabajo
Comandancia de Operaciones Navales
SUBM-MT Wilmer Miñan Castro
Escuela de Calificación y Perfeccionamiento
SUBM-MQ Hugo Vinueza Solís
Dirección Nacional de los Espacios Acuáticos 
SUBM-AB Edgar Galeas Buñay
Dirección General de Talento Humano
SUBM-IM Roger Mori Caicedo
DIRECCIÓN GENERAL DE EDUCACIÓN Y DOCTRINA
SUBM-IN Nelson Cerón Ronquillo
Cuerpo de Infantería de Marina
SUBM-IM Víctor Hugo Moreno Vallejo
Comandancia de Operaciones Norte 
SUBM-SU Wilson SANAGUANO Sánchez
INSPECTORÍA GENERAL 
SUBM-SU Eduardo Izael TURUCHINA ORELLANA
COMANDANCIA DE ESCUADRA
SUBM-ET Fausto Aspi García
Escuela de Grumetes 
SUBM-AD José Vásquez Hermenegildo
Comando de Guardacostas 
SUBM-IN Carlos Alegría Quiñónez